Trois espèces de chauve-souris ont été identifiées dans le marais, le Grand murin Myotis myotis, le Murin de Bechstein Myotis bechsteinii et le Murin à oreilles échancrées Myotis emarginatus, ce dernier très rare en île-de-France. On rencontre également le Campagnol roussâtre. Le ragondin Myocastor coypus, naguère menaçant, est en régression.

Ragondin sur la glace