Le marais occupe une dépression dont le fond varie de 61 à 66 m, barré à l'aval par un seuil de 82 m de sable et d'argiles qui le sépare du Loing. A l'est, une gouttière naturelle à 70 m, probablement l'émissaire d'un « lac de Larchant », dans laquelle un canal fut creusé au XVIIe siècle, la « rivière sèche », pour évacuer les eaux vers le Loing. Mais son seuil à 68 m est trop haut pour être l'exutoire d'un marais dont le plus haut niveau historique n'a pas dépassé 66 à 66,5 m.

Le golfe de Larchant, vue du sud-ouest. Juin 2006